CTCP Vật tư kỹ thuật nông nghiệp Bình Định được thành lập năm 2005 với 100% vốn nhà nước. Đến năm 2015, toàn bộ vốn nhà nước được sang cho 4 nhà đầu tư tư nhân, đồng thời Công ty thay đổi đăng ký kinh doanh lần thứ 11, chuyển đổi thành công ty cổ phần với 100% vốn tư nhân.
Theo bản án sơ thẩm, Nguyễn Thanh Long (SN 1966, ở Bình Định) vào Công ty làm từ tháng 3/1996 với vị trí thủ kho, chuyên quản lý, theo dõi việc nhập, xuất hàng hóa phân bón của Công ty. Việc nhập, xuất hàng do Phòng kinh doanh lập chứng từ. Bị cáo lưu giữ một liên các chứng từ ghi vào thẻ kho để theo dõi. Hàng tháng, hàng năm Công ty không kiểm kê hàng hóa mà chỉ căn cứ số liệu do Phòng kinh doanh lập.
Lợi dụng vị trí thủ kho, năm 2013, Long lấy phân bón NPK Jordan trong kho bán với giá thấp. Nguyễn Thị Trang (SN 1959, nguyên Giám đốc Công ty TNHH Thương mại và Dịch vụ Anh Trang) đồng ý mua. Mỗi khi cần bán, Long điện thoại trực tiếp cho Trang để thỏa thuận số lượng và giá cả.
Để tránh bị phát hiện, Long vẫn ký xác nhận vào sổ theo dõi hàng hóa. Đến ngày 16/12/2015, Công ty tiến hành kiểm kê đột xuất kho hàng thì phát hiện số phân trong kho bị Long chiếm đoạt số lượng 192.050 kg, giá trị là hơn 1,7 tỷ đồng. Khi vụ việc vỡ lở, Long bồi thường và khắc phục số tiền 681 triệu đồng.
VKSND tỉnh Bình Định truy tố bị cáo Long tội Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản và Trang tội Tiêu thụ tài sản do người khác phạm tội mà có. Cuối năm 2018, tòa án xử phạt bị cáo Long mức án 7 năm tù và Trang 4 năm tù. Sau đó, Viện trưởng VKSND Cấp cao tại Đà Nẵng đã kháng nghị bản án trên theo hướng hủy bản án sơ thẩm, bổ sung tội danh Tham ô tài sản, tăng mức phạt tù với bị cáo Long.
Mới đây, TAND Cấp cao tại Đà Nẵng đã đưa vụ án ra xét xử phúc thẩm. Cấp phúc thẩm thấy rằng, từ năm 2013-2015 là thời điểm xảy ra phạm tội, Công ty có 57,43% vốn góp nhà nước. Nhưng dù sau thời điểm trên, Công ty có sự thay đổi vốn góp hoặc quyền sở hữu thì tính chất hành vi bị cáo không thay đổi và còn trong thời hạn truy cứu trách nhiệm hình sự. Hành vi lợi dụng chức vụ thủ kho để chiếm đoạt tài sản đã cấu thành tội Tham ô tài sản.
Cơ quan tố tụng tỉnh Bình Định cho rằng sau ngày 31/5/2015, Công ty chuyển đổi mô hình công ty cổ phần và phần vốn nhà nước không còn. Số phân bón của nhà nước mà bị cáo chiếm đoạt trước đó cũng đã được bán sang cho tư nhân và Nhà nước không còn bị thiệt hại. Vì vậy, chỉ điều tra, truy tố, xét xử bị cáo tội Lạm dụng tín nhiệm chiếm đoạt tài sản.
Cấp phúc thẩm thấy rằng quan điểm trên là không đúng nên quyết định hủy bản án sơ thẩm để điều tra, xét xử lại, bổ sung tội danh Tham ô tài sản đối với bị cáo Long và xem xét hành vi đồng phạm của bị cáo Trang.
