Năm 2014, Tổng cục thuế tiến hành thanh tra đối với CTCP Vinagame và ngày 12/3/2014, Tổng cục thuế đã ban hành Kết luận Thanh tra số 20/KL-TCT trong đó có nội dung về xác định ưu đãi miễn thuế.
Theo đó, Bộ Tài chính có văn bản số 11818/BTC-TCHQ ngày 05/9/2011 hướng dẫn thực hiện tiêu chí xác định dự án sử dụng thường xuyên từ 500 lao động trở lên để làm căn cứ miễn thuế nhập khẩu hàng hóa tạo tài sản cố định của dự án thuộc lĩnh vực sử dụng thường xuyên từ 500 lao động trở lên.
Qua thanh tra, Tổng cục thuế xác định CTCP VNG hoạt động theo Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh số 4103002645 do Sở Kế hoạch và đầu tư cấp ngày 09/9/2004. Công ty bắt đầu cung cấp dịch vụ trò chơi trực tuyến (game online) cho khách hàng và ghi nhận doanh thu từ tháng 8/2005.
Trong các năm 2004, 2005, 2006, số lao động bình quân của Công ty dưới 500 lao động. Từ năm 2007 trở đi, số lao động sử dụng bình quân trong năm của Công ty đạt trên 500 lao động.
Khi kết luận thanh tra, Tổng cục thuế đã căn cứ văn bản số 11818 nói trên để xác định thời điểm dự án hưởng ưu đãi đầu tư và xử lý truy thu thuế thu nhập doanh nghiệp hơn 78 tỷ đồng cho 2 năm 2011 (hơn 33,8 tỷ đồng) và năm 2012 (hơn 44,2 tỷ đồng).
Theo Thanh tra Chính phủ, Thanh tra Tổng cục thuế đã áp dụng văn bản số 11818 để truy thu thuế của Vinagame không đúng quy định.
Tuy nhiên, theo báo cáo của Tổng cục thuế, đến thời điểm thanh tra, Vinagame đã nộp hơn 78 tỷ đồng tiền thuế mà không có khiếu nại gì.
Vinagame được biết đến như là công ty cung cấp các trò chơi trực tuyến hàng đầu ở Việt Nam với tựa game đầu tiên là Võ lâm truyền kỳ tạo nên cơn sốt tại Việt Nam. Với thành công lĩnh vực game online, Vinagame tiếp tục lấn sân sang mảng kinh doanh web với hệ thống nhãn hiệu Zing.
Năm 2009, Vinagame công bố chương trình quyền mua cổ phiếu dành cho nhân viên. Cho đến nay, Vinagame không niêm yết nhưng cổ phiếu của doanh nghiệp từng được đồn đoán lên tới hơn 500.000 đồng/CP.
Công ty đã xin gia hạn công bố báo cáo tài chính kiểm toán năm 2016.
Theo báo cáo hợp nhất quý IV/2016, Vinagame có tổng tài sản là 3.502 tỷ đồng, tăng 29% so với năm trước.
Tài sản ngắn hạn là 2.311 tỷ đồng trong đó tiền gửi ngân hàng có kỳ hạn dưới 3 tháng là 526 tỷ đồng, tiền gửi ngân hàng có kỳ hạn dưới 1 năm là 641 tỷ đồng.
Nợ phải trả là 622 tỷ đồng và phần lớn là nợ ngắn hạn (612 tỷ đồng).
Năm 2016, doanh thu bán hàng đạt hơn 3.023 tỷ đồng, lợi nhuận sau thuế là 543 tỷ đồng.
