Hệ thống VNACCS/VCIS nhằm giúp Tổng cục Hải quan xây dựng và phát triển hệ thống thông quan tự động dựa trên nền tảng công nghệ Nhật Bản.
Hệ thống sẽ chính thức triển khai từ ngày 1/4/2014 theo hình thức cuốn chiếu lan tỏa và đến ngày 25/6/2014 sẽ được triển khai trên phạm vi toàn quốc tại tất cả 34 Cục Hải quan tỉnh/thành phố.
Để thực hiện công việc trên, Tổng cục Hải quan đã thiết lập bộ máy tổ chức hỗ trợ người sử dụng hệ thống từ Trung ương đến địa phương. Tại Tổng cục Hải quan và các Cục Hải quan tỉnh/thành phố đều có bộ phận giải đáp thường trực hỗ trợ doanh nghiệp làm thủ tục hải quan trên hệ thống VNACCS/VCIS.
Tổng cục Hải quan cũng thiết lập một chuyên mục riêng giải đáp về hệ thống VNACCS/VCIS tại cổng thông tin điện tử hải quan, mở các đường dây nóng hỗ trợ người sử dụng hệ thống. Trong thời gian đầu triển khai hệ thống, Tổng cục Hải quan tiếp tục tăng cường các đoàn công tác xuống trực tiếp hỗ trợ các Chi cục Hải quan triển khai chính thức Hệ thống VNACCS/VCIS.
Doanh nghiệp xuất nhập khẩu hàng hóa khi làm thủ tục hải quan có thể liên hệ trực tiếp với các bộ phận giải đáp tại các địa điểm làm thủ tục hải quan để nhận trợ giúp hoặc truy cập chuyên mục dự án VNACCS/VCIS trên cổng thông tin điện tử hải quan để có thông tin và được tư vấn.