Cảng Nha Trang hoạt động theo mô hình CTCP từ 8/7/2014, đến nay đã cơ bản xong các thủ tục đăng ký doanh nghiệp theo quy định, bộ máy hoạt động đã bắt đầu thích nghi với mô hình mới.
Tuy nhiên, doanh nghiệp đang gặp rất nhiều khó khăn trong hoạt động sản xuất kinh doanh, hàng hóa thông qua ít, cán bộ nhân viên không đủ việc làm, thu nhập không đảm bảo cuộc sống cho người lao động, quyền lợi của cổ đông không được đảm bảo…
Trước những khó khăn vướng mắc trên, UBND tỉnh Khánh Hòa đề xuất phương thức chuyển giao có thanh toán đối với Cảng Nha Trang. Sau khi tiếp nhận, tỉnh Khánh Hòa sẽ tạo mọi điều kiện hỗ trợ cho Cảng Nha Trang trong hoạt động sản xuất kinh doanh để Công ty tiếp tục phát triển; đảm bảo đời sống, việc làm, thu nhập cho người lao động.