Đại hội đã bầu ra Ban Chấp hành Trung ương khóa XIII gồm 180 đồng chí, trong đó có 119 đồng chí là Ủy viên và Ủy viên Dự khuyết Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XII tái đắc cử, 61 đồng chí lần đầu trúng cử.
Đại hội cũng bầu 20 đồng chí Ủy viên Dự khuyết Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XIII.
Trong ngày 31/1, Ban Chấp hành Trung ương khóa XIII đã tiến hành Hội nghị lần thứ nhất bầu Bộ Chính trị, Tổng Bí thư, Ban Bí thư, Uỷ ban Kiểm tra Trung ương, Chủ nhiệm Uỷ ban Kiểm tra Trung ương.
Đồng chí Nguyễn Phú Trọng, Tổng Bí thư Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XII, Chủ tịch nước, được Ban Chấp hành Trung ương khóa XIII tiếp tục tín nhiệm bầu giữ chức Tổng Bí thư Ban Chấp hành Trung ương Đảng khóa XIII.
Hội nghị cũng bầu Bộ Chính trị gồm 18 đồng chí, trong đó có 8 đồng chí Ủy viên Bộ Chính trị khóa XII tái đắc cử, 7 đồng chí là Ủy viên Ban Bí thư Trung ương Đảng khóa XII và 3 đồng chí Ủy viên Trung ương Đảng khóa XIII được bầu tại Hội nghị.
Ban Bí thư Trung ương khoá XIII gồm một số đồng chí Uỷ viên Bộ Chính trị được Bộ Chính trị phân công tham gia Ban Bí thư và 5 đồng chí được bầu tại Hội nghị lần thứ nhất Ban Chấp hành Trung ương khoá XIII.
Hội nghị bầu ra Uỷ ban Kiểm tra Trung ương khoá XIII gồm 19 đồng chí; đồng chí Trần Cẩm Tú tiếp tục được bầu làm Chủ nhiệm Uỷ ban Kiểm tra Trung ương khoá XIII.
