Khai trương hoạt động vào ngày 14/7/2005 với hành trang ban đầu là 6 loại cổ phiếu niêm yết và 10 công ty chứng khoán thành viên, đến nay, thị trường niêm yết tại sàn Hà Nội quy tụ sự tham gia của trên 231 DN niêm yết, gần 100 công ty chứng khoán thành viên, với gần 700.000 nhà đầu tư mở tài khoản giao dịch.
Quy mô giao dịch trên thị trường niêm yết tại HNX từng năm có sự tăng trưởng vượt bậc: từ 2 tỷ đồng/phiên vào tháng 7/2005, đến 9,4 tỷ đồng/phiên vào năm 2006; 259,37 tỷ đồng/phiên năm 2007; 271,8 tỷ/phiên năm 2008, và 778,8 tỷ đồng/phiên năm 2009 (tính đến ngày 30/10/2009). Trong thời gian đầu, sàn thứ cấp Hà Nội được áp dụng theo phương thức giao dịch thoả thuận, là phương thức giao dịch tiêu biểu của thị trường tự do. Từ tháng 11/2005, Sở đã được Ủy ban Chứng khoán Nhà nước chấp thuận cho áp dụng thêm phương thức báo giá, tạo điều kiện cho nhà đầu tư lựa chọn hình thức giao dịch thích hợp. Việc đưa phương thức giao dịch báo giá vào hoạt động song song với giao dịch thỏa thuận là yếu tố quan trọng làm tăng tính thanh khoản và khối lượng hàng hóa giao dịch. Theo thống kê, tỷ trọng giao dịch theo phương thức báo giá chiếm ưu thế chủ yếu qua các năm, hiện nay chiếm khoảng 96% khối lượng giao dịch toàn thị trường.