Theo cáo trạng, qua công tác quản lý địa bàn, cơ quan điều tra phát hiện từ năm 2010 - 2012, Trung tâm Artex Hà Nội có nhiều sai phạm trong công tác quản lý, sử dụng tiền ngân sách nhà nước.
Quá trình điều tra xác định, Trung tâm Artex Hà Nội là đơn vị trực thuộc, hạch toán phụ thuộc Công ty TNHH Nhà nước MTV Xuất khẩu và Đầu tư Hà Nội (Công ty Unimex Hà Nội).
Các sai phạm của Trung tâm Artex bị cơ quan điều tra phát hiện từ năm 2016. Trước đó, vào năm 2010, Trung tâm Artex thành lập Tổ thu mua sắn lát và tinh bột sắn do Mạch Thanh Hưng là Tổ trưởng. Từ năm 2011 đến 2012, Hưng nhận 145,5 tỷ đồng để tiến hành công việc thu mua.
Do cần tiền thanh toán các khoản nợ ngân hàng, Phạm Văn Thắng chỉ đạo Mạch Thanh Hưng chuyển số tiền 11,4 tỷ đồng vào tài khoản của Trần Thị Lan Hương. Tuy nhiên sau đó, Hương sử dụng số tiền này để chi trả hoa hồng môi giới cho ông Trần Ngọc Hưng, Giám đốc Công ty TNHH Thiết bị khoa học kỹ thuật Hải Ly (gần 4 tỷ đồng) và cho Công ty TNHH Thương mại Đắc Nguyên vay 4 tỷ đồng (lãi suất 6%/tháng) để trả nợ cho chính Trung tâm Artex Hà Nội.
Số tiền 1,9 tỷ đồng còn lại, Trần Thị Lan Hương đã chi trả cho việc chi tiếp khách, chi thưởng các dịp lễ, Tết cho các đơn vị, cá nhân có quan hệ kinh doanh và lãnh đạo Unimex Hà Nội theo chỉ đạo của giám đốc. Việc chi hoa hồng môi giới, Trung tâm Artex Hà Nội không báo cáo với Unimex Hà Nội.
Trước đó, năm 2005, thông qua các mối quan hệ xã hội, Thắng có quen biết với ông Hưng để nhờ môi giới một số đối tác cho Trung tâm Artex cung cấp trang thiết bị khoa học, y tế. Hai người thống nhất, nếu có hợp đồng thì trung tâm phải trả 3% phí môi giới/tổng giá trị gói thầu. Việc chi hoa hồng Trung tâm Artex không báo cáo cho Công ty Unimex Hà Nội.
Cơ quan chức năng xác định, Thắng đã giao cho Hương hợp thức các giấy tờ, cân đối sổ sách để chi 4 tỷ đồng môi giới cho ông Hưng. Thắng còn chỉ đạo Hương chi ngoài sổ sách hơn 3 tỷ đồng để chi đối ngoại vào các dịp lễ, tết và cho Công ty TNHH Thương mại Đắc Nguyên vay 4 tỷ đồng (lãi suất 6%/tháng) đến nay không thu hồi được.
Tòa án nhận định hành vi của các bị cáo gây thất thoát số tiền hơn 11 tỷ đồng.
