Quỹ được công bố với nguồn vốn ban đầu do SHB cam kết tài trợ 30 tỷ đồng, trong đó năm 2016 tài trợ 10 tỷ đồng. SHB cũng đã tài trợ 500 triệu đồng cho cuộc thi Ý tưởng khởi nghiệp - Startup Wheel 2016 với danh vị nhà tài trợ Kim cương.
OCB và HDBank là những đơn vị cùng hưởng ứng với vai trò thành viên góp vốn cho Quỹ HSIF theo lộ trình, hướng đến mục tiêu 100 tỷ đồng và có thể nhiều hơn nữa vào năm 2020.
HSIF được hình thành với mong muốn giúp các doanh nhân khởi nghiệp Việt Nam nói chung, TP. HCM nói riêng phát triển được dự án khởi nghiệp sáng tạo của mình.