Năm 2009, Công ty đặt chỉ tiêu tổng doanh thu 670 tỷ đồng, lợi nhuận trước thuế 15 tỷ đồng.
Năm 2008, APFCO đã phát hành cổ phiếu để trả cổ tức và phát hành thêm cổ phiếu theo chương trình lựa chọn cho người lao động, tăng vốn điều lệ từ 18,94 tỷ đồng lên 32,6 tỷ đồng. ĐHCĐ năm 2009 của APFCO đã thông qua kế hoạch phát hành 810.000 cổ phiếu phổ thông (mệnh giá 10.000 đồng/CP) cho cổ đông hiện hữu để tăng vốn điều lệ lên 40,7 tỷ đồng. Ngoài ra, trong năm 2009, APFCO sẽ tham gia một số dự án lớn như nghiên cứu, thực hiện thí điểm phát điện từ gas tại Nhà máy Sơn Hà, sau đó phát điện cho các nhà máy khác; đưa dự án Biogas tại Nhà máy Quảng Ngãi đi vào hoạt động; khởi công xây dựng chợ Quảng Ngãi…