Theo cáo trạng, từ tháng 11/2008 đến tháng 5/2014, Trường và Thảo bàn bạc, thống nhất thành lập công ty chuyên bán hóa đơn giá trị gia tăng (GTGT). Thông qua người quen, Trường nhờ họ đứng tên pháp nhân, lập 16 công ty. Sau đó, Trường chuyển lại cho Thảo các quyển hóa đơn để tổ chức bán.
Cặp đôi này thuê địa điểm ở 11 Yên Bái 1, phường Phố Huế, Hai Bà Trưng làm nơi giao dịch, bán hóa đơn. Để tổ chức việc bán hóa đơn, cả hai tìm người làm thuê gồm Nguyễn Thị Thu Hương, Hồ Hoàng Oanh và Trịnh Hữu Hợp.
Các nhân viên này biết rõ các công ty không hoạt động kinh doanh, chỉ nhằm mục đích mua bán hóa đơn nhưng vẫn giúp sức cho ông chủ.
Tháng 9/2013, Cục thuế TP. Hà Nội phát hiện 8 công ty do Trường là giám đốc có dấu hiệu mua bán trái phép hóa đơn và đề nghị cơ quan điều tra vào cuộc.
Tổng số tiền Trường và Hợp rút được tại các ngân hàng là 5,454 tỷ đồng.
Căn cứ tổng số tiền do các đơn vị, công ty, cá nhân chuyển đến tài khoản của 14 công ty do Trường thành lập xác định, số tiền Trường và Thảo hưởng lợi bất chính là 38,1 tỷ đồng. Trong đó, bản thân Trường hưởng lời 22,9 tỷ đồng; Thảo là 15,2 tỷ đồng.
Đặc biệt, cặp đôi này đã bán hóa đơn cho các đơn vị, tổ chức, doanh nghiệp, cá nhân có nhu cầu mua bán hóa đơn để hợp thức hàng hóa dịch vụ đầu vào nhằm giảm thuế GTGT.
Cơ quan điều tra làm rõ, 2 công ty có hành vi trốn thuế gồm CTCP Công nghệ Việt Hóa do Nguyễn Văn Cử làm Giám đốc và Trung tâm truyền thông hỗ trợ phát triển khoa học công nghệ do Nguyễn Mạnh Tuấn làm Giám đốc.
Cụ thể, bị cáo Nguyễn Văn Cử có hành vi trốn thuế số tiền 4,3 tỷ đồng và Nguyễn Mạnh Tuấn là 413 triệu đồng.
Giữ vai trò đồng phạm giúp sức, các nhân viên Hương, Oanh, Hợp lĩnh mức án từ 3 tháng - 15 tháng tù nhưng cho hưởng án treo. Hai bị cáo Nguyễn Văn Cử và Nguyễn Mạnh Tuấn lĩnh án từ 3 tháng tù treo đến 4 tháng, 24 ngày tù về tội Trốn thuế.
