Nguyên nhân chính khiến BSI kinh doanh lỗ nặng là do giá trị đánh giá lại chênh lệch chứng khoán tự doanh theo giá trị thị trường.
Tại ngày 30/9/2016, giá đóng cửa cuối ngày của các mã chứng khoán giảm nhiều, nên giá trị đánh giá chênh lệch giảm trong quý III/2016 khá lớn (hơn 11,7 tỷ đồng), trong khi giá trị đánh giá chênh lệch tăng chỉ là 1,4 tỷ đồng.
Thị trường khó khăn, nhiều biến động, nhà đầu tư giao dịch hạn chế, nên thị phần môi giới cũng như doanh thu từ các dịch vụ liên quan đến giao dịch chứng khoán giảm sút, cũng khiến BSI thua lỗ.
